中国科学技术大学环境工程科学实验室成立于2001年。实验室位于校园东区油脂楼，拥有280平方米的使用面积和450多万元的仪器设备。并具备自行设计和建造的20套废水处理反应器和30多台配置良好的计算机，能够进行水污染控制和废物资源化的基础和应用基础研究工作。6年来实验室在国外SCI源刊物发表论文116篇，申请国家发明专利8项。

    实验室主要研究方向包括废水的生物处理技术、模拟和调控，污染控制功能材料，有机废弃物资源化理论和技术，湖泊富营养化控制技术。目前正在独立承担国家自然科学基金委、科技部863计划、中国科学院、教育部和安徽省资助的科研课题。

    实验室现有30人，其中固定人员5人，流动人员25人。